Se l'andamento è frastagliato solo in altezza puoi costruire un solaio di forma irregolare che ricalchi l'andamento della tua muratura e poi dalla finestra 3d scegli la vista frontale, azimuth con angolo 90° e dal menu "Archivio" scegli "Oggetti GDL" e "Salva modello 3d come..". Lo puoi anche ridimensionare a piacimento :)
Uno dei problemi potrebbe essere l'inserimento di eventuali aperture. Puoi combinare l'oggetto ottenuto in precedenza con una muratura standard altrimenti puoi "bucare" direttamente il solaio in fase di costruzione ma ti consiglio la prima ipotesi perchè molto più gestibile (almeno personalmente!)....Buon lavoro!