Se usi una Mesh, devi lasciare una differenza di posizione planimetrica fra i punti, dovrebbe bastare anche un valore molto piccolo (1cm o meno).
Le superfici complesse, come quella che vuoi realizzare, non fanno parte delle possibilità native di ArchiCAD, purtroppo...
Si potrebbe provare, con ArchiForma, a creare una superficie tipo SWEEP e usarla come operatore booleano su un muro noermale, ma non sono sicuro del risultato (queste operazioni hanno bisogno di SOLIDI, non di SUPERFICI).