Forse il solido che usi come operatore non è abbastanza grande. Si suggerisce di non limitarsi a misure "precise", che portano le superfici a coincidere. Se l'operatore è un prisma (o un cilindro orizzontale), il suo spessore dovrebbe essere maggiore dello spessore del muro, e sporgere un po' da ciascun lato.
Ma perché non usi un'apertura vuota ad arco? La trovi in libreria, con lo strumento PORTA.