Annesso realizzato prima dell'entrata in vigore PRG (1969) quindi sicuramente legittimo urbanisticamente ( questa è sicuramente l'unica certezza)
Per questo punto è necessario dimostrare che l'annesso era esistente alla data del 01/09/1967......
Solo se il comune accetta l'autocertificazione, resa dal proprietario, può ritenersi "legittimo".....dichiarazione che potrebbe essere smentita da qualche foto aerea fatta in quel periodo (magari per fare la carta tecnica regionale ,...)......
Con la stessa dichiarazione dovresti poter sistemare anche il discorso ambientale.....
L'unico vero problema sono le locali sovrintendenze che richiedono la presentazione dell'autorizzazione paesaggistica anche nei caso di edifici molto vecchi,a volte realizzati prima dell'imposizione del vincolo, applicando la norma in modo retroattivo.....
Nel tuo caso temo che non ti resti che concordare, cosa e come fare, con l'ufficio tecnico e con il sovrintendente....